SVjazano v pervuju ochered' s tem, chto rabota s USB delaetsja sovershenno po raznomu v Windows i Linux, i s Linux'om ja nikak ne doberus' razobratsja. V principe vopros dolzen bit' reshaemij, skoree vsego eto mozno sdelat' s ispol'zovaniem libusb (http://www.libusb.org/). Esli est' vremja i zelanie dobavit' podderzku USB pod Linux, budet ochen' horosho.