Пока я вижу только один возможный путь появления таких дубликатов - если в процессе network discovery сервер нашел оба адреса, но на SNMP они не отзувались - то добавлены были оба. Позже, когда SNMP агент стал отвечать, сервер добавил остальные интерфейсы и добавил ноды в соответствующие подсети. Могло такое быть что изначально это устройство на SNMP запросы с сервера не отвечало?